27日，上海、深圳、東京等地船運公司稱，上周（20日當周）中國海關開始提高中日進出口商品的現場檢查比例，某些情況下甚至需100%檢查。通常海關僅對貿易商品做少量抽查，其比例僅為10%。

在日本檢方24日釋放被扣押的中國漁船船長后，中國反日情緒依然高漲。這起扣押事件只是兩國島嶼領土爭端縮影。

中國當局放緩海關監察可能是種憤怒表現，不過物流企業表示它們并不確定加強檢查原因所在。放緩恰逢中國中秋三天國定假，期間企業和政府活動通常會放緩但不會停止。日本上周同樣放假。

中國是日本最大貿易伙伴，日本方面數據顯示，上半年兩國進出口規模約為1,380億美元。清關持續放緩至少可能暫時干擾兩國企業活動。

27日，受訪發貨商稱眼下增加檢查將在很大程度上形成阻礙，商品清關可能延遲。

中國海關北京總部發言人拒絕置評。上海海關發言人表示未得到相關信息。北京當地海關官員表示，“未對日本往來貿易貨物采取更嚴格檢查措施”，“日本往來貨物與其他貨物同等對待”。其他城市海關電話無人接聽。

深圳騰龍物流（Shenzhen Tenglong Logistics Co.，音譯）業務經理表示，公司所有日本航線貨物都要接受檢查。她表示：“目前公司中日進出口業務幾乎停止。”星青（上海）國際貿易公司（Blue Express （Shanghai） International Trade Inc.）一位經理表示，該公司貨物檢查率約為50%，平時僅為10%到20%。

日本方面。日本通運公司（Nippon Express Co.）表示，近幾天該公司由日本出口至上海、北京及中國其他城市的貨物在當地的檢查率由平時10%到20%大幅升至30%到40%。

不過這一變化似乎并未影響所有中日貿易。上海銳諾物流公司（Shanghai Morepro Int'l Logistics Co.，音譯）一名經理表示未看到任何影響。日本煤炭開發公司（Japan Coal Development Co.，由日本公用事業企業持股10%的合資企業）官員表示沒有看到放緩，但他擔心如果控制措施繼續在位，公司未來煤炭貨物將受影響。該官員表示：“9月貨物已經收到，（但）我們非常擔憂10月交付情況。”

23日，稀土業分析人士稱中國已停止向日本出口稀土礦物，這或許與上述中國通關放緩情況有關。在稀土貿易受困背景下，媒體紛紛報道中國已禁止稀土出口以報復日本扣留中國漁船船長，這些報道亦令國際社會對中國近乎壟斷稀土資源這一現狀感到擔憂。稀土是生產電動汽車電池及其他高科技和國防產品必要原料。

中日兩國政府均否認稀土貿易遭禁，上述清關延長問題原因依然不明。